2007年7月9日科技部批准了36个首批企业国家重点实验室建设申请，我院“新农药创制与开发”国家重点实验室名列其中。
2006年底科技部为营造激励自主创新的环境，促进以企业为主体、市场为导向、产学研相结合的技术创新体系建设，全面启动了在转制院所和企业建设国家重点实验室的工作。农药所积极组织材料申报，经过答辩评审，“新农药创制与开发”国家重点实验室建设申请获得科技部批准，现已进入国家重点实验室建设阶段。该实验室将实行“开放、流动、联合、竞争”的运行模式，开展学术交流与合作，推进产学研结合。
建设该实验室的目的在于完善新农药研究和开发体系，提高创新能力，创制具有自主知识产权的新品种并实现产业化，提高我国新农药研究和开发技术水平。“新农药创制与开发”国家重点实验室的建设将有助于增强我院的技术辐射能力，进而带动农药行业整体技术进步。