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科学家发明大尺度鉴定mirna靶点新方法-伟博体育

时间:2010-10-20     来源:科学网
《自然一方法学》网络版近日介绍了瑞典苏黎世大学生命科学研究所迈克尔.恩加特纳(michael o hengartner)研究组发明的一种大尺度鉴定mirna靶点新方法。


  在过去几年中,随着实验和计算方法的发展和完善,mirna靶点的鉴定和预测研究取得很大进展。然而,全面正确的鉴定mirna的生物学相关靶点依然是个难点。恩加特纳研究组发明了一种叫做“选择性反应监测”(seleted reaction montitoring,srm)的方法,该方法利用有针对性的质谱技术实现了对mirna靶点互作的大尺度蛋白组学分析,进而对预测的靶点进行验证。


  恩加特纳等人利用线虫let-7突变体及其野生型为实验材料。为了测定于let-7突变数量减少致的蛋白含量的下降,恩加特纳等人对感兴趣的let-7突变体和野生型的蛋白提取物进行化学标记,之后一套对照基因。结果发现,161个蛋白中的29个蛋白的表达含量在突变体中发生变化,这可能是由于let-7基因和不同的靶点互作结果--该结果得到了独立下游试验包括遗传互作、多聚核糖分析和荧光霉素检验的验证。

  srm技术可以作为一个验证工具来进一步探索对于靶点的理解;此外,srm也可能用来精细描述目标蛋白质组亚群,促进mirna生物功能模型的研究。

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